Υπάρχει ένα τεράστιο δέσιμο ανάμεσα στην ΑΕΚ και τον Φερνάντο Σάντος, με τον Πορτογάλο τεχνικό να μην ξεχνά τα χρόνια που πέρασε στον «κιτρινόμαυρο» πάγκο. Η σχέση του με την Ένωση παραμένει ξεχωριστή, ακόμη και αρκετά χρόνια μετά την αποχώρησή του.
Ο 72χρονος επισκέφθηκε στην Κρήτη το Μουσείο της ΑΕΚ Iraklio Eagles, όπου φωτογραφήθηκε φορώντας ένα κασκόλ της ομάδας.
Ο Σάντος έκανε το χατίρι σε αρκετούς φίλους της Ένωσης που βρίσκονταν εκείνη τη στιγμή στο Μουσείο και φωτογραφήθηκε μαζί τους, ενώ μοίρασε και αυτόγραφα.
Ο Σάντος ήρθε για πρώτη φορά στην Ελλάδα για χάρη της ΑΕΚ τη σεζόν 2001/02, αποχώρησε στο τέλος της και επέστρεψε το καλοκαίρι του 2004, παραμένοντας στην ομάδα μέχρι το καλοκαίρι του 2006.
